Ključna razlika između slobodnog amonijaka i ukupnog amonijaka je u tome što se pojam slobodni amonijak odnosi na plinovite molekule NH 3, dok se pojam ukupni amonijak odnosi na zbroj molekula NH 3 i amonijevih iona.
Amonijak je otrovna plinovita tvar kemijske formule NH 3. U biološkim sustavima amonijak se može pojaviti u dvije vrste kao ionizirani oblik i kao neionizirani oblik. Jonizirani oblik je amonijev ion koji ima kemijsku formulu NH 4 +.