Transposon vs Retrotransposon
Transpozoni i retrotranspozoni genetske su sastavnice DNA i među njima postoje velike razlike. Postotak prisutnosti ovih genetskih materijala razlikuje se među vrstama, a njihove funkcije određuju sudbine organizma s mutacijama i drugim fenotipski važnim promjenama. Transpozoni i retrotranspozoni su geni ili kolekcije određenih gena smještenih u lancima DNA, a promjene na njihovom mjestu glavni su uzroci tih posljedica. Međutim, ovaj članak namjerava ukratko raspraviti funkcije ovih gena i predstavlja usporedbu između transpozona i retrotranspozona.
Što je Transposon?
Transpozoni su zanimljivi fragmenti ili segmenti DNA s mogućnošću promjene mjesta lanca DNA u obliku mehanizma za rezanje i lijepljenje. Zbog ove pokretne prirode transpozona, oni su poznati kao geni koji skaču. Transpozoni su dvije glavne vrste poznati kao Transpozoni klase I i Transpozoni klase II. Obično se tip klase II naziva transpozonima, a tip klase I retrotranspozonima. Procesi rezanja i lijepljenja pokretnih segmenata DNA regulirani su enzimom transposazom. Enzim se veže na oba kraja transpozona i presijeca fosfodiesterske veze DNA lanca, izolira transposon, premješta ga na ciljno mjesto i veže se na novom mjestu. Međutim, ovaj je proces zanimljivo razumjeti,jer se neki transpozoni mogu premjestiti samo na određena mjesta samo zbog nespojivosti nizova baze s ciljnim mjestom. Geni s jednim krajem jednog lanca imaju isti bazni slijed s drugim krajem drugog pojedinačnog lanca su transpozoni s ljepljivim rubovima, jer se oni mogu vezati za mjesta ciljnoga lanca DNA s istim nizom baza kao na ljepljivim krajevima. Međutim, ova pokretljivost gena može uzrokovati promjene genotipa kao i fenotipa organizma. Tada su dostupni znanstvenici izumljeni o transpozonima i genetski modificiranoj hrani i organizmima prema željenim prilagodbama. Visoko produktivne poljoprivredne kulture, antibiotici s ljekovitim svojstvima,stočne životinje bili su neki od povoljno razvijenih proizvoda nakon što je Barbara McClintock izumila transposone 1940-ih.
Što je Retrotransposon?
Retrotransposons are the Class I transposons, and these move through the genome through the mechanism of copy and paste. The mechanism of the mobility of retrotransposons involves few major steps such as copying of the gene segment of the DNA strand into RNA, transfer of the copy of RNA to the target site, transcription of the RNA sequence back to DNA using reverse transcriptase, and insertion of the gene into the new location of DNA strand of genome. The two ends of these retrotransposons usually have long terminal repeats with about 1000 base pairs, and those are used as identification features of these genes. These genes are easily amplified inside the genome, and the percentage of the retrotransposons in the human genome is about 50%. These could be quite dangerous as the causative virus of AIDS, HIV, and T-cell leukaemia virus have the retrotransposons in their RNA genomes. In fact, these viruses can bind the retrotransposons into any site of the human DNA strands with the use of reverse transcriptase and integrase. The integrase enzyme functions the same way as transposase in Class II transposons.
Koja je razlika između Transpozona i Retrotranspozona?
• Transpozoni su gene za skakanje klase II, dok retrotranspozoni spadaju u kategoriju I. klase
• Transposoni funkcioniraju s enzimom transpozaze, dok retrotranspozoni funkcioniraju uz upotrebu dva glavna enzima poznata kao reverzna transkriptaza i integraza.
• Krajnji krajevi su puno duži u retrotranspozonima nego u transpozonima.
• Transpozoni se izrezuju s podrijetla i lijepe na metu; obrnuto, retrotranspozoni se kopiraju s ishodišta u RNA i transkribiraju na meti.
• Kretanje retrotranspozona uključuje RNA, ali ne i transpozone.
