Ključna razlika - Taq polimeraza vs DNA polimeraza
DNA polimeraza je enzim koji stvara novu DNA iz svojih gradivnih blokova (nukleotida). U prokariota i eukariota nalaze se različite vrste DNA polimeraza. Umnožavanje DNA moguće je zbog prisutnosti ovih posebnih enzima, a genetske informacije potomcima se prenose djelovanjem DNA polimeraza. Taq polimeraza je posebna vrsta DNA polimeraze koja je termostabilna i široko se koristi u PCR-u. Taq polimeraza nalazi se u termofilnim bakterijama i pročišćava se in vitro replikacijom DNA. Ključna razlika između Taq polimeraze i DNA polimeraze je ta što Taq polimeraza može podnijeti visoke temperature bez denaturiranja, dok druge DNA polimeraze denaturiraju na visokim temperaturama (na temperaturama razgradnje proteina).
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je Taq polimeraza
3. Što je DNA polimeraza
4. Usporedba - Taq polimeraza vs DNA polimeraza
5. Sažetak
Što je Taq polimeraza?
Taq polimeraza (Taq DNA polimeraza) je enzim koji se koristi za sintezu DNA in vitro PCR tehnikom. Proizvodi ga termofilna bakterija nazvana Thermus aquaticus koja živi u vrućim izvorima i termalnim otvorima. Taq polimeraza je termostabilni enzim koji se ne razgrađuje na visokim temperaturama. Taq polimeraza je prvi put pročišćena i objavljena u Chien i sur. 1976. PCR tehnika izvodi se uz pomoć Taq polimeraze zbog svoje sposobnosti da tolerira visoke temperature i temperaturne fluktuacije tijekom PCR-a. Taq polimeraza katalizira sintezu DNA kada postoje početnici, nukleotidi i jednolančana matrica DNA. Enzim se sastoji od jednog polipeptida s molekularnom težinom od približno 94 kDa. Taq polimeraza pokazuje svoje optimalno djelovanje na 80 ° C i u rasponu od 7 - 8 pH uz prisustvo magnezijevih iona. Ima i aktivnost polimeraze i eksonukleaze. Enzim se sastoji od jednog polipeptidnog lanca, a gen za Taq polimerazu sadrži visok sadržaj G i C (67,9%).
Termostabilna Taq polimeraza omogućuje provođenje PCR-a na visokim temperaturama koje povećavaju specifičnost početnica i smanjuju stvaranje neželjenih PCR proizvoda (dimerovi primera). Taq polimeraza također eliminira potrebu za dodavanjem novih enzima u PCR reakciju nakon svakog i svakog PCR reakcijskog ciklusa zbog svoje sposobnosti da podnese visoke temperature. Otkriće Taq polimeraze omogućilo je PCR-u da se izvodi u jednoj zatvorenoj cijevi u relativno jednostavnom stroju. Zbog ovih svojstava Taq polimeraze, PCR postaje popularna rutinski izvedena laboratorijska tehnika u mnogim molekularno-biološkim analizama u vezi s DNK analizom.
Taq polimeraza se široko koristi u molekularno biološkim tehnikama, a postoji potreba za velikom proizvodnjom Taq polimeraze. Stoga je, koristeći tehnologiju rekombinantne DNA i kloniranje gena, gen koji je kodirao Taq DNA polimerazu kloniran i eksprimiran u Escherichia coli. To je uvelike olakšalo proizvodnju rekombinantne Taq polimeraze i smanjilo cijenu ovog enzima za odgovarajuću upotrebu.
Slika 1: Taq polimeraza
Što je DNA polimeraza?
DNA polimeraza je enzim koji katalizira sintezu DNA iz nukleotida. To je najtočniji enzim odgovoran za umnožavanje genoma i prosljeđivanje genetskih podataka potomstvu. Tijekom diobe stanica, DNK polimeraza duplicira svu svoju DNA i prosljeđuje po jednu kopiju svakoj kćeri. 1955. godine Arthur Kornberg je otkrio DNA polimerazu u E Coli. Funkcija DNA polimeraze ovisi o nekoliko zahtjeva; predloška DNA, ioni Mg +2, sve četiri vrste deoksinukleotida (dATP, dTTP, dCTP i d GTP) i kratki slijed RNA (primer). Sinteza DNA vrši se u smjeru 5'to 3 'pomoću DNA polimeraze.
DNA polimeraze mogu se grupirati u sedam različitih porodica: A, B, C, D, X, Y i RT (Reverse transcriptase). Retrovirusi kodiraju za RT; neobična DNA polimeraza kojoj je potreban RNA predložak za sintezu DNA. Postoji pet različitih vrsta DNA polimeraza koje se nalaze u prokarionima za različite uloge u replikaciji DNA. DNA polimeraza 3 odgovorna je za polimerizaciju novog lanca DNA. DNA polimeraza 1 odgovorna je za popravak i krpanje DNA. DNA polimeraze 2, 4 i 5 odgovorne su za popravak i lekturu DNA. U eukariota postoji 15 različitih vrsta DNA polimeraza. Obuhvaćaju pet glavnih obitelji.
Slika 2: DNA polimeraza
DNA polimeraze koriste se u kloniranju gena, PCR-u, sekvenciranju DNA, otkrivanju SNP-a, molekularnoj dijagnostici itd. Taq polimeraza je jedna vrsta DNA polimeraze koja može podnijeti visoke temperature i biti dostupna za sintezu DNA bez razgradnje.
Koja je razlika između Taq polimeraze i DNA polimeraze?
Diff Article Sredina prije tablice
Taq polimeraza vs DNA polimeraza |
|
Taq DNA polimeraza je enzim koji stvara DNA. To je termostabilni enzim koji se nalazi u termofilima | DNA polimeraza je enzim koji olakšava replikaciju DNA, a nalazi se i u prokariotskim i u eukariotskim organizmima. |
Razgradnja na visokim temperaturama | |
Taq polimeraza aktivna je na visokim temperaturama. | DNA polimeraze se razgrađuju na proteinima koji denaturiraju visoke temperature. |
Koristiti | |
To se široko koristi u PCR-u | Taq polimeraza zamijenila je DNK polimerazu iz coli koja se izvorno koristila u PCR-u. |
Sažetak - Taq polimeraza vs DNA polimeraza
DNA polimeraze su enzimi koji sintetiziraju DNA iz deoksinukleotida (građevni blokovi DNA) kada su predložak i početnice dostupni. DNA polimeraze potrebne su za umnožavanje DNA stanica i prelazak u identične stanice kćeri tijekom diobe stanice. DNA polimeraze dodaju nove nukleotide na 3 'kraj početnice i produžuju novu sintezu lanca DNA u smjeru 5' do 3 '. Taq DNA polimeraza jedan je od enzima DNA polimeraze koji je vrlo koristan u lančanoj reakciji polimeraze (PCR) za pojačavanje DNA. DNA polimeraza E. coli 1 korištena je ranije za PCR, ali komercijalna Taq polimeraza ju je istisnula zbog visoke specifičnosti vezivanja početnice na povišenim temperaturama i stvaranja većeg prinosa željenog produkta s manje nespecifičnim produktom amplifikacije. To je razlika između Taq polimeraze i DNA polimeraze.