Ključna razlika - VNTR vs STR
DNK studije imaju ogromnu korist u razumijevanju i određivanju filogenetskih odnosa, dijagnosticiranju genetskih bolesti i mapiranju genoma organizma. Nekoliko tehnika povezanih s analizom DNA koristi se za identifikaciju određenog gena ili DNA sekvence u skupu nepoznate DNA. Poznati su kao genetski biljezi. Genetički biljezi koriste se u molekularnoj biologiji kako bi se identificirale genetske varijacije između jedinki i vrsta. Tandemsko ponavljanje varijabilnog broja (VNTR) i kratko tandemsko ponavljanje (STR) dvije su vrste genetskih markera koji pokazuju polimorfizam među pojedincima. Obje vrste su nekodirajuće ponavljajuće DNA koje su tandem ponavljanja. Oni su u kromosomima raspoređeni na način od glave do repa. VNTR je dio genoma gdje se kratki nukleotidni slijed ponavlja nekoliko puta. STR je još jedan dio DNA unutar genoma koji je organiziran kao ponavljajuće jedinice koje se sastoje od dva do trinaest nukleotida u stotinu puta. Ključna razlika između VNTR i STR je broj nukleotida u sekvenci koja se ponavlja. Ponavljajuće jedinice VNTR sastoje se od 10 do 100 nukleotida, dok se ponavljajuće jedinice STR sastoje od 2 do 13 nukleotida. VNTR i STR široko se koriste u forenzičkim studijama.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je VNTR
3. Što je STR
4. Sličnosti između VNTR i STR
5. Usporedna usporedba - VNTR protiv STR u tabličnom obliku
6. Sažetak
Što je VNTR?
Tandemsko ponavljanje kratka je sekvenca DNA koja se ponavlja od glave do repa na određenom kromosomskom lokusu. U tandemskom ponavljanju nema druge sekvence ili nukleotida. Postoji nekoliko vrsta tandemskih ponavljanja u genomu. VNTR je vrsta tandemskih ponavljanja među njima koja ima ponavljajuće jedinice koje se sastoje od 10 do 100 nukleotida. VNTR je vrsta mini-satelita. Ta tandemska ponavljanja mogu se naći u mnogim kromosomima. Oni su prošarani unutar ljudskog genoma i pretežno su smješteni u subtelomernim regijama kromosoma.
VNTR pokazuju tandemski ponovljeni polimorfizam među pojedincima. Duljina VNTR-a na određenom mjestu kromosoma vrlo je varijabilna među pojedincima zbog razlike u broju ponavljajućih jedinica organiziranih u tom DNA dijelu. Stoga se VNTR može koristiti kao snažan alat za identifikaciju pojedinaca, a analiza VNTR koristi se u mnogim poljima, uključujući genetiku, biološka istraživanja, forenziku i DNK otiske prstiju. VNTR su prvi genetski biljezi korišteni za kvantificiranje transplantacije koštane srži. VNTR su također bili prvi polimorfni biljezi koji se koriste u DNK profiliranju u forenzici.
Slika 01: Varijacija VNTR-a kod šest pojedinaca
VNTR analiza provodi se polimorfizmom dužine restrikcijskog fragmenta praćenom južnjačkom hibridizacijom. Stoga mu je potreban relativno velik uzorak DNA. Tumačenje profila VNTR također je problematično. Zbog ovih ograničenja, uporaba VNTR-a u forenzičkoj genetici ograničena je i zamijenjena je STR analizom.
Što je STR?
STR je visoko ponavljajući DNA odjeljak koji se sastoji od dvije do trinaest jedinica za ponavljanje nukleotida koje su organizirane na tandem način. STR je sličan VNTR-u. Ali to varira od VNTR od broja nukleotida u ponavljajućem slijedu i broja ponavljanja. STR je vrsta mikrosatelita.
STR analiza uključena u mjerenje točnog broja ponavljajućih jedinica. STR su vrlo varijabilni među pojedincima, slično VNT-ima. STR profili se razlikuju od osobe do osobe. Stoga se STR analiza koristi u molekularnoj biologiji za usporedbu specifičnih lokusa na DNA iz dva ili više uzoraka. Stoga se STR smatraju važnim genetskim biljezima u molekularnoj biologiji. Pruža izvrstan alat za identifikaciju pojedinaca zbog visokog stupnja polimorfizma i relativno kratke duljine.
Trenutno su STR-ovi najčešće korišteno analizirano sredstvo genetskog polimorfizma u forenzičkoj genetici. Većina forenzičkih slučajeva uključuje polimorfnu analizu STR. STR lokusi su rašireni po cijelom genomu. Postoje tisuće STR-a smještenih u kromosomima koji se mogu koristiti u forenzičkoj analizi. STR analiza ne uključuje polimorfizam ograničenja dužine poput VNTR analize. STR analiza ne reže DNA restrikcijskim enzimima. Specifične sonde koriste se za pričvršćivanje željenih regija na DNA i pomoću PCR tehnike određuju se duljine STR.
Slika 02: STR varijacija između uzoraka
Koje su sličnosti između VNTR i STR?
- VNTR i STR su nekodirajuća DNA.
- Oba su tandemska ponavljanja.
- Oboje pokazuju polimorfizam među pojedincima zbog razlike u duljini presjeka DNA.
- Obje se koriste kao snažni genetski biljezi u DNA otisku prstiju i u forenzičkim studijama.
Koja je razlika između VNTR i STR?
Diff Article Sredina prije tablice
VNTR vs STR |
|
| VNTR je nekodirajuća ponavljajuća DNA koja ima kratku nukleotidnu sekvencu ponovljenu na tandem način. | STR je visoko ponavljajući DNA odjeljak koji se sastoji od dvije do trinaest jedinica za ponavljanje nukleotida koje su organizirane na tandem način. |
| Veličina | |
| VNTR-ovi su veći od STR-ova. | STR su manji od VNTR-a. |
| Broj nukleotida u ponavljajućem nizu | |
| Ponavljajuća jedinica VNTR sastoji se od 10 do 100 nukleotida. | Ponavljajuća jedinica STR sastoji se od 2 do 13 nukleotida. |
Sažetak - VNTR vs STR
VNTR i STR dva su snažna genetska biljega koja se koriste u molekularnoj biologiji, posebno u području forenzičke genetike. VNTR je vrsta mini-satelita, a STR mikro-satelit. VNTR i STR su nekodirajuća, vrlo ponavljajuća DNA. To su tandem ponavljanja. Opća struktura VNTR i STR ista je. Međutim, broj nukleotida u ponavljajućem nizu i duljina su različiti. VNTR ima ponavljajuće se sekvence koje se sastoje od 10 do 100 nukleotida. STR ima ponavljajuće sekvence koje se sastoje od 2 do 13 nukleotida. To je razlika između VNTR i STR.
Preuzmite PDF verziju VNTR vs STR
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti je u izvanmrežne svrhe prema napomenama o navodima. Ovdje preuzmite PDF verziju. Razlika između VNTR i STR.
