Ključna razlika između fluorovodične kiseline i solne kiseline je u tome što je fluorovodonična kiselina slaba kiselina, dok je solna kiselina jaka kiselina. Također, fluorovodonična kiselina sposobna je stvoriti vodikove veze, dok solna kiselina nije u stanju stvoriti vodikove veze.
Štoviše, još jedna važna razlika između fluorovodične i solne kiseline je u njihovoj molekularnoj strukturi. Molekula fluorovodonične kiseline ima fluoridni ion, dok molekula klorovodične kiseline ima kloridni ion. Nadalje, fluorovodična i klorovodična kiselina donatori su protona. Stoga se ove molekule kiseline mogu ionizirati u vodenim medijima oslobađajući protone (H +). Ti protoni uzrokuju kiselost u vodenom mediju.
