Ključna razlika između supstrata i aktivnog mjesta je u tome što je supstrat kemijski spoj koji može proći kemijsku reakciju, dok je aktivno mjesto određeno područje na enzimu.
Enzimi su biološki katalizatori. To su proteini koji mogu smanjiti energiju aktivacije kemijske reakcije kako bi smanjili energetsku barijeru te reakcije. Stoga može povećati brzinu reakcije. Reaktant reakcije u kojoj enzimi sudjeluju je "supstrat". Ovaj se supstrat veže s aktivnim mjestom enzima. Tamo se odvijaju reakcije. Na kraju oslobađa produkte reakcije.
