Ključna razlika između peptida i dipeptida je u tome što je peptid kratki lanac aminokiselina koji se međusobno povezuju peptidnim vezama, dok je dipeptid oblik peptida koji ima dvije aminokiseline spojene s jednom peptidnom vezom ili jednu aminokiselinu s dvije peptidne veze.
Aminokiseline su gradivni blokovi proteina. Stoga oni međusobno tvore peptidne veze tvoreći kratke lance aminokiselina; nazivamo ih "peptidi". Dugi i kontinuirani peptidni lanci su "polipeptidi". Ti se polipeptidni lanci međusobno povezuju da bi stvorili proteine. Pojam peptid uobičajeni je pojam kojim nazivamo kratki lanac aminokiselina, ali izraz dipeptid je specifičan pojam kojim nazivamo određenu vrstu peptida.
