Ključna razlika između neurotransmitera i hormona je u tome što su neurotransmitori kemijski glasnici koje živčani sustav koristi za prijenos živčanog impulsa kroz sinapse, dok su hormoni kemijski glasnici koje endokrini sustav koristi za stimuliranje ili komunikaciju sa određenim ciljnim stanicama.
Živčani sustav i endokrini sustav vrlo su važni organski sustavi u našem tijelu koji reguliraju različite aktivnosti. Oba sustava ovise o oslobađanju posebnih kemikalija bilo kao neurotransmiteri, bilo kao hormoni. Ti neurotransmiteri i hormoni djeluju kao kemijski glasnici i olakšavaju prijenos živčanog impulsa i regulaciju fizioloških aktivnosti u našem tijelu.