Ključna razlika između fermentacije i disanja je ta što se fermentacija događa u odsutnosti kisika dok disanju treba kisik.
Organizmi zahtijevaju energiju za obavljanje staničnih aktivnosti. Stoga generiraju molekule energije u obliku ATP. Koriste različite podloge i razgrađuju se u različite oblike, a energija koja se oslobađa pretvara se u molekule energije koje stanice mogu koristiti. Glukoza je primarni supstrat mnogih organizama. Fermentacija i disanje dva su stanična procesa koja generiraju energiju razgradnjom glukoze u nekoliko koraka. Međutim, disanje je učinkovitije i stvara više ATP molekula od fermentacije.
