Ključna razlika između nefridija i malpigijevih tubula ovisi o njihovoj pojavi u organizmima. Nephridia su prisutna u nižim organizmima poput crva i mekušaca, dok su malpighijeve tubule prisutne u stražnjim dijelovima insekata i kopnenih člankonožaca.
Izlučivanje je važan aspekt živih organizama. Metabolički putovi generiraju različite proizvode koji se izlučuju kao nusproizvode. Međutim, nakupljanje otpada u živom tjelesnom sustavu je otrovno i štetno. Stoga je prisutnost mehanizma za uklanjanje metaboličkog otpada iz tijela sustavom izlučivanja nužna. Stoga su različite vrste organa za izlučivanje prisutne u različitim skupinama organizama. Nephridia i malpighian tubule dva su primjera takvih organa za izlučivanje.
