Ključna razlika između endocitoze i egzocitoze je ta što endocitoza unosi tvari u stanicu, dok egzocitoza transportira tvari u vanjsku stranu stanice.
Stanica ima staničnu membranu koja djeluje kao prepreka između stanične unutrašnjosti i vanjskog okruženja. Stoga, imajući takvu membranu, stanicama je potreban nekakav transportni mehanizam za povezivanje s vanjskim okolišem. Na primjer, stanice trebaju dobivati hranjive sastojke i izlučivati otpad iz stanice. U tu svrhu stanice imaju četiri osnovna mehanizma prijenosa: difuziju, osmozu, aktivni transport i rasuti transport. Difuzija i osmoza su pasivni procesi, dok su aktivni transport i rasuti transport aktivni procesi koji troše energiju. Endocitoza i egzocitoza dvije su vrste mehanizma za rasuti transport, koji transportiraju velike čestice kroz plazemsku membranu, bilo iz stanice u vanjsko okruženje ili iz vanjskog okruženja u stanicu. Oba ova mehanizma tvore vezikule vezane na membranu kao sredstvo prijevoza.
