Ključna razlika između točkaste mutacije i kromosomske mutacije je u tome što je točkovna mutacija mutacija malog opsega u kojoj se mijenja jedan bazni par sekvence DNA ili RNA, dok je kromosomska mutacija mutacija velikih razmjera u kojoj se mijenja struktura kromosoma.
Mutacija je promjena ili promjena nukleotidnog slijeda DNA ili RNA. Mutacije su glavni uzrok genetske varijabilnosti među organizmima. Mutacije se javljaju u somatskim stanicama, kao i u stanicama zametne linije. Neke mutacije nasljeđuje sljedeća generacija, dok druge nisu nasljedne. Somatske mutacije utječu na sadašnji organizam, dok se mutacije klica prenose na sljedeću generaciju. Točkaste mutacije i kromosomske mutacije dvije su uobičajene vrste mutacija. Točkaste mutacije najjednostavniji su tip mutacija koji nastaju uslijed promjene jedne baze para. S druge strane, kromosomske mutacije donekle su velike promjene u kojima se u organizmu mijenja struktura ili broj kromosoma.