Ključna razlika između AMPA i NMDA receptora je ta što je specifični agonist AMPA receptora alfa-amino - 3 - hidroksil - 5 - metil - 4 - izoksazol propionska kiselina (AMPA), dok je specifični agonist NMDA receptora N - metil - D - aspartat (NMDA).
Postoje tri glavne vrste receptora za glutamat. Njihova se razlika temelji na agonistu koji se veže za aktivaciju receptora za vezanje glutamata. Vezanje glutamata otvorit će ionske kanale za transport iona natrija i kalija. Također, NMDA receptori također olakšavaju protok kalcijevih iona kroz membranu.