Ključna razlika između Punnettovog kvadrata i rodovnice je u tome što Punnettov kvadrat prikazuje sve moguće genotipove koji se mogu naslijediti od dva roditeljska genotipa, dok rodoslovlje predstavlja obiteljsku povijest određene osobine, posebno nasljeđivanje gena.
Punnettov kvadrat i rodovnik dvije su vrste alata koji pomažu utvrditi vjerojatnost nasljeđivanja gena. Oboje pokazuju vjerojatnost nasljeđivanja određene osobine potomstva. Drugim riječima, obojica predviđaju obrasce nasljeđivanja u obiteljskim linijama. Stoga mogu pomoći u utvrđivanju rizika od nasljedne bolesti kod djeteta. Punnettov kvadrat je jednostavno grafički način prikazivanja svih mogućih genotipova koji se mogu pojaviti u djece od dva roditelja.
