Ključna razlika između primarnog i sekundarnog alilnog karbokationa je u tome što je primarni alilni karbokation manje stabilan od sekundarnog alilnog karbokationa.
Alilni karbokat je struktura ugljika stabilizirana rezonancijom. To je ion koji sadrži pozitivan naboj. U tim se ionima pozitivni ion postavlja na alilni atom ugljika (alilični atom ugljika je susjedni atom dvostruke veze). Primarni alilni karbokacija je alilni karbokacija gdje se pozitivni naboj stavlja na primarni atom ugljika, dok je sekundarni alilski karbokatiol alični karbokacija gdje se pozitivni naboj nalazi na sekundarnom atomu ugljika.
