Ključna razlika između Harrisa i Mayerovog hematoksilina je u tome što se Harrisov hematoksilin koristi u regresivnom bojanju, dok se Mayerov hematoksilin koristi u progresivnom bojenju.
Hematoksilin je osnovna boja koja se uobičajeno koristi u histopatologiji. Prirodna je boja ekstrahirana iz stabla Haematoxylon campechianum. Riječ je o boji tamnoplave ili ljubičaste boje. Hematoksilin omogućuje demonstraciju mikroskopskih nuklearnih detalja staničnih i tkivnih komponenata. Ova je boja pozitivno nabijena, stoga se veže s negativno nabijenim tvarima kao što su DNA i RNA i boji ih u ljubičastu boju. Hematoksilin zahtijeva lijek koji pomaže povezivanju s komponentama tkiva. Mordant je kemijska tvar, posebno sol aluminija, željeza, volframa, koja olakšava povezivanje boje s komponentom tkiva.
Na temelju mrvica koje sadrže, dostupno je nekoliko vrsta hematoksilina. Neki od njih su Ehrlichov, Mayerov, Harrisov, Gillov, Delafieldov, Coleov i Carazzijev hematoksilini. I Harrisova i Mayerova formulacija hemoksilina su hematoksilini na bazi aluminija.
