siRNA vs miRNA
RNA su vrlo važne molekule, koje pomažu izgraditi život organizama. Nedavno su znanstvenici otkrili male RNA zvane RNA interferencija ili RNAi, koje nakon transkripcije djeluju na kontrolu ekspresije gena. Dvije glavne vrste malih RNA su mikro RNA ili miRNA i male interferirajuće RNA ili siRNA. Te molekule u osnovi reguliraju ekspresiju gena suzbijajući ciljni gen. I miRNA i siRNA imaju vrlo slične putove biogeneze, iako postoje neke razlike između njih. Podrijetlo miRNA i siRNA potječu od molekula dsRNA. Zrele miRNA strukturno su slične molekulama siRNA.
miRNA
Mikro RNA ili miRNA su male molekule RNA koje posreduju u konačnoj provjeri u translacijskoj regulaciji gena. Deregulacija miRNA može dovesti do razvoja raka i drugih bolesti. Stoga je pravilna regulacija informacija kodiranih u nekodirajućem području miRNA vrlo kritična u mnogim temeljnim staničnim procesima.
siRNA
siRNA se također nazivaju RNA koja interferira ili utišava, a sastoje se od dvolančane RNA s 20 do 25 parova baza. Glavna uloga siRNA je ometati ekspresiju specifičnih gena komplementarnim nukleotidnim sekvencama. siRNA se sastoji od kratke dvolančane RNA s fosforiliranim 5 'krajevima i hidroksiliranim 3' krajevima s dva nadvijena nukleotida.
Koja je razlika između siRNA i miRNA?
• miRNA izvedena iz specifičnih genomskih lokusa, dok je siRNA izvedena iz mRNA, transpozona, virusa ili heterokromatske DNA.
• Sinteza miRNA obrađuje se iz dužih transkripata ukosnice prekursora (primarna nuklearna sekvenca miRNA pomoću RNase III endonukleaze), dok se ona iz siRNA obrađuje iz dugih bimolekularnih RNA dupleksa.
• Svaka molekula prekursora miRNA ukosnice stvara jedan dupleks miRNA, dok svaka molekula prekursora siRNA stvara višestruke duplekse siRNA.
• siRNA sekvence se rijetko konzerviraju, dok se miRNA sekvence dobro čuvaju.
• Sve baze unutar siRNA doprinose njenoj ciljanoj specifičnosti, dok samo 5 'polovica miRNA doprinosi njezinoj ciljanoj specifičnosti.
• miRNA se često vežu za 3 'neprevedeno područje ciljnih transkripata, dok siRNA tvore komplementarni dupleks bilo gdje duž ciljne mRNA.
• miRNA navode "hetero-tišinu", dok se siRNA koristi za "automatsko utišavanje".
• miRNA djeluje kao signal za sprječavanje translacije, dok siRNA fizički sprečava prijevod.