Ključna razlika - proteomika vs transkriptomija
Omic tehnologija je trenutni trend, gdje se na različite biomolekule organizma gleda kao na cjelovitu zbirku s obzirom na njegova svojstva i funkcije. Tehnologija omic ima širok spektar aplikacija. Različite omike biološkog uzorka uključuju genomiku, proteomiku, transkriptomiku i metabolomiku. Proteomika uključuje cjelovito proučavanje svih proteina u živom organizmu. Definiran je kao skup svih izraženih bjelančevina u organizmu, njegovih strukturnih i funkcionalnih svojstava. Kompletni skup proteina, dakle, tvori proteom. Transkriptomija je cjelovito proučavanje svih molekula glasničke RNA (mRNA) prisutnih u živom organizmu. Dakle, transkriptomija se bavi genima koji se aktivno izražavaju u živom organizmu. Ukupni skup mRNA u živom organizmu naziva se transkriptom. Ključna razlika između proteomike i transkriptomike temelji se na vrsti biomolekule. U proteomici se proučava ukupan skup eksprimiranih proteina u živom organizmu, dok se u transkriptomici proučava ukupna mRNA živog organizma.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je proteomika
3. Što je transkriptomija
4. Sličnosti između proteomike i transkriptomike
5. Usporedba - Usporedba proteomike i transkriptomije u tabličnom obliku
6. Sažetak
Što je proteomika?
Pojam proteomika nastao je 1995. godine i u početku je definiran kao ukupni proteinski komplement u stanici, tkivu ili organizmu. S napretkom u proteomskim studijama, tada je izmijenjen da bi se smatrao krovnim pojmom u koji su uključena mnoga područja proučavanja. Trenutno se pod temom proteomika proučava struktura, usmjerenje, funkcije, interakcije, modifikacije, primjena i važnost proteina. Stoga se trenutno provodi mnogo istraživanja na polju proteomike.
Provedena su prva proteomska ispitivanja kako bi se utvrdio sadržaj proteina u Escherichia coli. Mapiranje ukupnog sadržaja proteina izvedeno je pomoću dvodimenzionalnih (2D) gelova. Nakon uspjeha ovoga, znanstvenici su prešli na karakteriziranje ukupnog sadržaja proteina u životinjama poput zamorčića i miševa. Trenutno se mapiranje ljudskih proteina vrši pomoću 2D gel elektroforeze.
Primjene proteomike
Mnogo je prednosti proučavanja proteomike, jer su proteini upravljačke molekule većine aktivnosti zbog katalizatorskog svojstva proteina. Dakle, proučavanje cjelovitih bjelančevina može pružiti informacije o zdravstvenom stanju organizma. Neke su aplikacije;
- Anotacija genoma: Proučavanjem sadržaja proteina u organizmu mogu se odrediti točni genomi odgovorni za aktivni proteinski spoj. U ovom su scenariju važni rezultati iz svih genoma, transkriptomika i proteomika.
- Identifikacija / dijagnostika bolesti: Proteomics se koristi za identifikaciju stanja bolesti, uspoređujući zdrave i bolesne
- Za provođenje ekspresije proteina proučavane tijekom eksperimenta.
- Modifikacije proteina i studije interakcija: Kako bi se proteini koristili u uvjetima in vivo ili i in vivo, odlučili o uvjetima skladištenja ovih ekstrahiranih proteina i proučavali ponašanje proteina u in vitro, in vivo i in silico metodama.
Slika 01: Proteomika
Postoje različite tehnike uključene u proteomiku
- Ekstrakcija ukupnog proteina i odvajanje proteina pomoću 2D gel elektroforeze. Proteini se također mogu odvojiti pomoću tekućinske kromatografije visokih performansi (HPLC).
- Sekvenciranje ekstrahiranih proteina pomoću metoda poput Edmundove metode sekvenciranja ili masene spektrometrije.
- Jednom kada se sekvence identificiraju, strukturna i funkcionalna svojstva sadržaja proteina analiziraju se pomoću računalnog softvera i alata za bioinformatiku.
Što je Transcriptomics?
Pojam transkriptoma skovan je nedavno. Transcriptomics je proučavanje ukupnog sadržaja mRNA u organizmu. Ukupna mRNA je eksprimirana DNA u živom organizmu ili stanici. Kompletna kolekcija mRNA naziva se transkriptom.
Koraci prema analiziranju transkriptoma uključuju,
- Ekstrakcija RNA, odvajanje mRNA uporabom gel kromatografije na stupcu s poli DT kuglicama.
- Završeno je sekvenciranje mRNA.
Tehnologija mikrorazreda jedan je od uobičajenih načina identificiranja transkriptoma organizma. Tehnika mikrorazreda uključuje sondnu pločicu s komplementarnim nitima transkriptoma. Nakon hibridizacije, mRNA prisutna u organizmu ili stanicama može se karakterizirati.
Slika 02: Transkriptomske tehnike
Transkriptomija se danas široko koristi u medicinskom području. Dijagnostika bolesti i profiliranje bolesti glavna su područja u kojima se koristi Transcriptomics. Analizom prijepisa organizma može se identificirati strana mRNA, a ako postoje infekcije, može se identificirati. Nekodirajuća RNA može se odvojiti pomoću transkriptomskih tehnologija. Također se može pratiti ekspresija gena pod različitim stresovima iz okoliša.
Koje su sličnosti između proteomike i transkriptomike?
- Obje čine dio koncepta omičke tehnologije.
- Obje se koriste u dijagnostici bolesti i karakterizaciji bolesti organizma.
- Oba područja ispitivanja uključivala su ekstrakciju biomolekule, odvajanje biomolekule i korake sekvenciranja.
Koja je razlika između proteomike i transkriptomike?
Diff Article Sredina prije tablice
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomika uključuje cjelovito proučavanje svih proteina u živom organizmu. | Transkriptomija je cjelovito proučavanje svih molekula glasničke RNA (mRNA) prisutnih u živom organizmu. |
| Studirao Bio molekularni tip | |
| Proteini se proučavaju u proteomici. | mRNA se proučavaju u transkriptomici. |
| Studirani faktori | |
| Struktura, funkcija, interakcije, modifikacije i primjena proteina proučavaju se u proteomici. | Struktura sekvence, interakcije s okolinom i primjene mRNA proučavaju se u transkriptomici. |
Sažetak - Proteomika vs Transcriptomics
Omics igra važnu ulogu na polju znanosti o životu. Proteomika se odnosi na proučavanje proteoma koji tvori kompletne kolekcije proteina u stanici ili organizmu. Transcriptomics se odnosi na proučavanje transcriptoma koji je kompletan skup eksprimirane DNA koja je u obliku mRNA. Dva područja proučavanja, proteomika i transkriptomija, izvedena su nakon uvođenja genomike i trenutno se široko koriste u medicinskoj dijagnostici te u karakterizaciji i probiranju organizama. To je razlika između proteomike i transkriptomike.
Preuzmite PDF Proteomics vs Transcriptomics
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti je u izvanmrežne svrhe prema napomeni. Preuzmite PDF verziju ovdje: Razlika između proteomike i transkriptomike
