Ključna razlika između izo i neo struktura je u tome što se prefiks iso odnosi na organski spoj koji sadrži sve atome ugljika, osim jednog koji tvori kontinuirani lanac, dok se prefiks neo odnosi na organski spoj koji sadrži sve atome ugljika, osim dva koji čine neprekidni lanac.
U organskoj kemiji koristimo prefikse kako bismo razlikovali jednu organsku molekulu od druge. Koristimo ove prefikse zajedno s nazivom spoja. Budući da su ovi prefiksi specifični za različite funkcionalne skupine u organskim molekulama, lako možemo identificirati organske molekule čak i ako imaju usko povezane kemijske strukture.