Ključna razlika između metafaze 1 i 2 je u tome što se u metafazi 1 homologni kromosomi pare na metafaznoj ploči, dok se u metafazi 2 pojedinačni kromosomi postavljaju na metafaznu ploču.
Mejoza je postupak koji pretvara diploidnu stanicu u četiri haploidne stanice tijekom stvaranja spolnih stanica. To je važan proces jer povećava genetsku raznolikost među potomcima. Mejoza je vitalna u spolnoj reprodukciji zbog svoje važnosti u stvaranju haploidnih stanica. Mejoza se javlja putem dvije uzastopne nuklearne podjele nazvane mejoza I i mejoza II. Svaka se nuklearna podjela može ponovno podijeliti na profazu, metafazu, anafazu i telofazu. Dakle, metafaza je faza stanične diobe u kojoj se kromosomi raspoređuju duž ploče Metafaze. Metafaza 1 može se naći u mejozi I, dok se metafaza 2 može naći u mejozi II. Metafaza 1 i 2 međusobno se razlikuju.