Ključna razlika između unutarnjeg i vanjskog disanja je u tome što se unutarnje disanje odnosi na skup metaboličkih reakcija koje se javljaju u stanicama radi stvaranja energije oksidacijom glukoze i drugih organskih molekula, dok se vanjsko disanje odnosi na proces premještanja kisika iz vanjske okoline do stanica i premještanje ugljičnog dioksida iz tijela u vanjsko okruženje.
Kad čujete izraz disanje, možda će vas podsjetiti na proces koji se naziva disanje. To je postupak udisanja i izdisaja zraka. Međutim, osim ovog procesa, postoji još jedan proces disanja koji se događa unutar stanica organizama. To je proces koji se naziva stanično disanje. Stoga se ova dva procesa, disanje i stanično disanje, nazivaju vanjskim i unutarnjim disanjem. U mnogim aspektima postoje razlike između unutarnjeg i vanjskog disanja. Ipak, unutarnje i vanjsko disanje međusobno se povezuju jer unutarnje disanje koristi kisik koji dolazi vanjskim disanjem, a vanjsko disanje uklanja ugljični dioksid; nusprodukt unutarnjeg disanja.