Ključna razlika između stomata i zaštitnih stanica je ta što su stomati pore koje se nalaze na epidermi lišća, stabljika itd., Dok su zaštitne stanice stanice koje okružuju i reguliraju otvaranje i zatvaranje stoma.
Respiracija i fotosinteza dva su vitalna procesa u biljkama. U oba procesa važna je izmjena plina. Stomate i zaštitne stanice olakšavaju ovaj posao izmjene plina u postrojenjima. Ovdje su zaštitne stanice stanice parenhima, a to su stanice koje okružuju stomate. Stražarske stanice kontroliraju transpiraciju, što je bitan proces biljaka koji održava biljke zdravima. Nadalje, zaštitne stanice sadrže klorofile. Stoga su sposobni i za fotosintezu.