Ključna razlika između asimilacijske i disimilacijske redukcije sulfata je u tome što asimilacijska redukcija sulfata daje cistein kao krajnji proizvod, dok disimilacijska redukcija sulfata daje sulfid kao krajnji proizvod.
Redukcija sulfata jedan je od glavnih anaerobnih dišnih putova. Nadalje, neki mikrobi koji ovise o anaerobnim uvjetima sposobni su reducirati sulfate kako bi dobili energiju. Štoviše, postoje dva glavna puta u kojima se sulfati reduciraju; oni su asimilacijski put i disimilacijski put. Pri tome, asimilacijskim putem, redukcija sulfata daje cistein kao konačni proizvod, koji se može asimilirati u živim organizmima poput biljaka i viših eukariota. Suprotno tome, disimilacijski put redukcije sulfata daje sulfid kao krajnji produkt. Stoga je najznačajnija, prepoznatljiva razlika između asimilacijske i disimilacijske redukcije sulfata vrsta krajnjeg proizvoda koji svaki proizvede.
