Ključna razlika između flore i faune je u tome što se flora odnosi na biljni svijet u određenoj regiji, dok se fauna odnosi na životinjski svijet u određenoj regiji.
Flora i fauna dva su općenita izraza koji se koriste za označavanje biljaka i životinja u određenoj regiji. Budući da flora predstavlja sve biljke, možemo reći da flora uključuje sve nepokretne autotrofne fotosintetske organizme. Slično tome, možemo reći da fauna uključuje sve pokretne heterotrofne organizme koji o izvorima hrane ovise o drugima. Stoga se ove riječi flora i fauna uglavnom koriste zajedno za opis biljnog i životinjskog svijeta u regiji ili području. Flora i fauna određenog mjesta važni su iz nekih razloga, posebno iz ekoloških razloga. Obje biljke, kao i životinje koje su autohtone na nekom mjestu, održavaju ekološku ravnotežu, a znanstvenici prate sve vrste kako bi utvrdili prijeti li neka od ovih vrsta opasnosti od izumiranja. Znanstvenici i zaštitari okoliša tada u uskoj suradnji smišljaju metode za obnavljanje ove osjetljive ekološke ravnoteže.
