Ključna razlika između kromatina i kromosoma je u tome što je kromatin raspetljana i nerazvijena DNA koja postoji kao kompleks DNK i histonskih proteina, dok kromosomi sadrže najvišu zgusnutu strukturu dvostruke spirale DNA za pravilno razdvajanje genetskog materijala između stanica kćeri.
Kromatin i kromosom su dvije kategorije struktura dvostruke zavojnice DNA koje su prisutne u različitim fazama stanice. Bitno je spakirati cijelu DNK koja pohranjuje genetske informacije o stanici u eukariotsku jezgru radi postojanja. Stoga je kromatin uobičajeni oblik pakirane DNA unutar stanice. S druge strane, kromosomi su najvažnije strukture u stanici tijekom diobe stanice, a sadrže genetski materijal u obliku DNA. To je zato što su oni odgovorni za prijenos nasljednih podataka s jedne generacije na drugu. Postoje dvije vrste kromosoma kao autosomi i spolni kromosomi. Spolni kromosomi važni su za određivanje spola, dok autosomi određuju ostale karakteristike. Općenito, kromosomi se pojavljuju tijekom metafaze stanične diobe.
