Ključna razlika između višestruke fisije i fragmentacije je u tome što je višestruka fisija vrsta fisije u kojoj se matična jezgra nekoliko puta mitozno dijeli, stvarajući nekoliko novih kćerkih stanica, dok je fragmentacija vrsta aseksualne reprodukcije u kojoj se roditeljski organizam samo razbija na nekoliko fragmenti koji su sposobni prerasti u nove jedinke.
Postoje dvije vrste razmnožavanja kao što su nespolno i spolno razmnožavanje. Bespolno razmnožavanje događa se od samohranog roditelja. Ne uključuje muške ili ženske spolne stanice. Štoviše, postoje različite vrste metoda nespolnog razmnožavanja. Neki od njih uključuju fisiju (binarna i višestruka fisija), usitnjavanje, regeneracija, pupanje, stvaranje spora. Međutim, ovaj se članak uglavnom fokusira na razliku između višestruke fisije i fragmentacije.