Ključna razlika između valencije i naboja je ta što valencija ukazuje na sposobnost kemijskog elementa da se kombinira s drugim kemijskim elementom, dok naboj označava broj elektrona dobivenih ili uklonjenih kemijskim elementom.
Valencija i naboj su usko povezani pojmovi jer oba pojma opisuju reaktivnost kemijskog elementa. Valencija je snaga kombiniranja elementa, posebno mjerena brojem atoma vodika s kojima može istisnuti ili kombinirati. S druge strane, naboj atoma je broj protona umanjen za broj elektrona u atomu.