Ključna razlika između parazita i bakterija je u tome što su bakterije jednoćelijski mikroskopski prokarioti koji žive posvuda, dok su paraziti organizmi koji žive na ili u svojim domaćinima dok domaćima uzrokuju infekcije.
Paraziti i bakterije su organizmi koji nalikuju vrlo primitivnim organizmima, ali imaju velike prilagodbe za preživljavanje u različitim uvjetima okoliša. Za ljude su ti organizmi najvažniji jer većinu ljudskih infekcija uzrokuju oni. Ponekad se određene bakterije smatraju parazitima.
