Ključna razlika između fenetike i kladistike je metoda koja se koristi za razvrstavanje organizama. Fenetika klasificira organizme na temelju morfoloških i strukturnih obilježja, dok kladistika klasificira organizme na temelju njihovih predaka i evolucijskih odnosa.
Klasifikacija organizama važan je proces biološke raznolikosti i bioloških studija. Taksonomija olakšava klasifikaciju različitih sustava, dok pomaže u grupiranju i grupiranju organizama. S tim u vezi, fenetika i kladistika igraju važnu ulogu u izgradnji odnosa među organizmima.
