Ključna razlika između zooidogamije i sifonogamije je ta što je zooidogamija stanje u kojem muške spolne stanice plivaju u vodi da bi došle do svojih ženskih spolnih stanica, dok je sifonogamija stanje u kojem su razvijene cijevi peludi koje nose muške spolne stanice do ženskih spolnih stanica.
Spolno se razmnožavanje događa na različite načine među različitim skupinama biljaka. Da bi dovršile oplodnju, muške spolne stanice trebale bi doći do ženskih spolnih stanica. Zooidogamija i sifonogamija dva su načina koja objašnjavaju kako muške spolne stanice putuju prema ženskim spolnim stanicama. U zooidogamiji, muške spolne stanice plivaju prema ženskim, dok u sifonogamiji, muške spolne stanice putuju kroz peludnu cijev prema ženskim spolnim stanicama. Na primjer, alge, briofiti, pteridofiti i neke golosjemenjače pokazuju zooidogamiju, dok biljke sjemena pokazuju sifonogamiju.
