Ključna razlika između prolaznog i uravnoteženog polimorfizma temelji se na ponašanju alela. Prolazni polimorfizam je progresivna zamjena jednog alela gena drugim alelom, dok je uravnoteženi polimorfizam održavanje oba dva različita alela gena tijekom vremena
Genetski polimorfizam je jedna ili dvije ili više varijanti određene DNA. Privremeni i uravnoteženi polimorfizam dvije su vrste polimorfizma koji nastaju zbog dva naizmjenična alela gena. U prolaznom polimorfizmu, iz dva naizmjenična alela datog lokusa, jedan se alel postupno zamjenjuje drugim. U uravnoteženom polimorfizmu, dva su alela međusobno u ravnoteži. Obje verzije gena održavaju se u populaciji.
