Ključna razlika između spojenog heterozigota i dvostrukog heterozigota je u tome što je složeni heterozigot pojedinac koji ima dva različita mutirana alela na određenom lokusu gena, dok je dvostruki heterozigot pojedinac koji je heterozigotan na dva odvojena genetska lokusa.
Generalno, gen ima dva alela budući da su organizmi diploidni. Aleli su varijantni oblici gena. Smješteni su u genetskom lokusu kromosoma. Postoje dominantni aleli kao i recesivni aleli. Ako pojedinac ima dva različita alela (jedan dominantan i jedan recesivni (Aa)) za lokus, nazivamo ga heterozigotom. Uvjet postojanja dva različita alela za gen naziva se heterozigotno stanje. Sastavljeni heterozigot i dvostruki heterozigot dvije su vrste heterozigotnih situacija. Spojeni heterozigot ima dva različita mutirana alela na određenom lokusu gena. Dvostruki heterozigot je heterozigotan na dva genska lokusa.