Ključna razlika između polisaharidnih i konjugiranih cjepiva je u tome što polisaharidna cjepiva sadrže samo slobodne polisaharide kao antigene, dok konjugirana cjepiva sadrže polisaharide u kombinaciji s proteinskom molekulom.
Polisaharidna i konjugirana cjepiva dvije su vrste cjepiva. Polisaharidna cjepiva sadrže samo polisaharidnu kapsulu kao antigen za poticanje imunološkog odgovora. Stoga uzrokuju zanemariv imunološki odgovor u usporedbi s konjugiranim cjepivima. Konjugirana cjepiva sadrže polisaharide konjugirane na imunogeni protein. Stoga izazivaju jači imunološki odgovor. Štoviše, konjugirana cjepiva uspostavljaju pamćenje B-stanica i dugotrajnu imunizaciju. Trenutno su konjugirana cjepiva znatno zamijenila polisaharidna cjepiva.
