Ključna razlika između uzlazne i silazne kromatografije papira je u tome što uzlazna kromatografija papira uključuje kretanje otapala u smjeru prema gore, dok silazna papirna kromatografija uključuje kretanje otapala u donjem smjeru.
Kromatografija na papiru je vrsta kromatografske tehnike u kojoj se komponente u smjesi analita raspodjeljuju i raspodjeljuju između tekućih faza. Općenito, papirna kromatografija koristi vodu kao jednu tekuću fazu; voda koja se zadržava u porama filtarskog papira koji se koristi za analizu je stacionarna faza dok se mobilna faza kreće kroz ovu stacionarnu fazu.