Ključna razlika - Bakterijske transpozaze nasuprot retrovirusnim integrazama
Prijenosni genetski materijal evoluirao je s dvije glavne strategije za prelazak iz jedne regije u sljedeću regiju unutar i između genoma. Jedna metoda je premještanje kroz molekulu RNA prije stvaranja molekule DNA, dok drugi put uključuje DNA intermedijere. Transpozaze i virusne integraze primjeri su takvog prenosivog genetskog materijala. Bakterijske transpozaze vežu se za kraj transpozona i olakšavaju katalizu kretanja transpozona u drugi dio genoma kroz razne mehanizme. Retrovirusne integraze su enzimi koji pomažu u integraciji genetskog materijala retrovirusa, poput HIV-a, u genetski materijal (DNK) stanice domaćina koju inficira. To je ključna razlika između bakterijskih transpozaza i retrovirusnih integraza.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što su bakterijske transposaze
3. Što su retrovirusne integraze
4. Sličnosti između bakterijskih transposaza i retrovirusnih integraza
5. Usporedna usporedba - Bakterijske transposaze i retrovirusne integraze u tabličnom obliku
6. Sažetak
Što su bakterijske transpozaze?
Transpozaza se može definirati kao enzim vezan za kraj transpozona koji olakšava katalizu kretanja transpozona u drugi dio genoma kroz različite mehanizme. Takvi mehanizmi uključuju "mehanizam izrezivanja i lijepljenja" i "mehanizam replikativne transpozicije". Transposaza je prvi put uvedena kloniranjem enzima koji je potreban za transpoziciju Tn3 transpozona. Transponibilni genetski elementi koristili su dvije važne strategije za pomicanje između genoma ili s jednog mjesta na drugo. Prijenos kroz intermedijar RNK prije sinteze DNA kopije jedna je od strategija, dok je druga vezana samo za intermedijare DNA. Reakcijske kombinacije koje su uključene u integraciju oba elementa odvijaju se zbog enzima specifičnih za elemente. Tako,u primjeru DNA elemenata, ti su enzimi poznati kao transpozaze, dok su u slučaju elemenata RNA poznati kao integraze.
Kada se uspoređuju razlike između obje strategije transpozicije, čini se da je postupak umetanja kemijski identičan. No, nedavni dokazi sugeriraju da se određene sličnosti u mehanizmu integracije vide u regijama aminokiselinskih sekvenci koje tvore aktivno mjesto; motiv DDE. Trenutno se klasificira pet obitelji transpozaza, ali broj obitelji tek će se povećati s novim znakovima transposaze. Obitelji uključuju DDE transpozazu, tirozin (Y) transposazu, serin (S) transpozazu, transposazu kotrljajućeg kruga, reverzne transkriptaze / endonukleaze (RT / En) itd. Ove obitelji koriste jedinstvene katalitičke mehanizme za razbijanje i ponovno spajanje DNA. DDE transpozaza uključuje mehanizam izrezivanja i zalijepljenja izvornog transpozona i nosi tri skupa konzerviranih aminokiselina;aspartat (D), aspartat (D) i glutamat (E). Tirozin transpozaze također sudjeluju u mehanizmu za rezanje i zalijepljivanje korištenjem ostataka tirozina, koji je specifičan za određeno mjesto.
Slika 01: Bakterijske transpozaze
Serinske transpozaze uključuju intermedijar kružne DNA i provode mehanizam za rezanje i lijepljenje baš kao gore navedene obitelji. Transpozaza kotrljajućeg kruga uključuje mehanizam kopiranja, gdje se pojedinačna nit izravno kopira na ciljno mjesto replikacijom DNA. To osigurava da pramen predloška i kopirani pramen imaju pramen koji je novo sintetiziran. Reverzna transkriptaza / endonukleaza transposaza ima različite mehanizme za transpoziciju.
Što su retrovirusne integraze?
U kontekstu Retrovirusne integraze, smatra se retrovirusnim enzimom koji pomaže u integraciji genetskog materijala retrovirusa kao što je HIV u genetski materijal (DNA) stanice koja je zaražena. Te se retrovirusne integraze najčešće zbunjuju s fagovim integrazama. Primjeri za fage integraze su λ fage integraze. Ali to su potpuno različiti enzimi i s njima se ne smije brkati. U pogledu stvaranja retrovirusnog predintegracijskog kompleksa, retrovirusna integraza igra glavnu ulogu. Proteini retrovirusne integraze obično se sastoje od tri (03) kanonske domene. Te su domene povezane fleksibilnim povezivačima.
Tri domene uključuju N terminalnu domenu koja veže cink gdje su tri spiralna snopa povezana i stabilizirana koordinacijom uz sudjelovanje Zn 2+kation, RNaza H preklopna katalitička jezgra domene i C terminalna DNA vezujuća domena, koja je SH3 nabor. Ispitivanjem i putem biokemijskih i strukturnih podataka sugerira da retrovirusna integraza ima sposobnost funkcioniranja kao dimer dimera (tetramer). U kontekstu multimerizacije i vezanja virusne DNA, sve tri domene proteina retrovirusne integraze. Glavna funkcija retrovirusne integraze je umetanje svog genetskog materijala u DNK domaćina. Ovaj korak je najvažniji korak u virusnoj replikaciji virusa HIV-a. Jednom uspješno integrirana, bit će tamo u kromosomskoj DNA stanice do kraja svog života.
Slika 02: Retrovirusne integraze
Stoga, jednom integrirana stanica nema povratka. Te retrovirusne integraze uključuju kataliziranje dviju glavnih reakcija, uključujući 3 'završnu obradu i kovalentnu ligaciju. Tijekom 3 'završne obrade uklanjaju se 2-3 nukleotida s oba 3' kraja virusne DNA s namjerom da se otkriju CA dinukleotidi 3 'krajeva virusne DNA, a tijekom kovalentne ligacije obrađeni 3' krajevi virusne DNA kovalentno se vežu u kromosomsku DNA domaćina.
Kakva je sličnost između bakterijskih transpozaza i retrovirusnih integraza?
I bakterijske transposaze i retrovirusne integraze imaju slične aminokiselinske sekvence
Koja je razlika između bakterijskih transpozaza i retrovirusnih integraza?
Diff Article Sredina prije tablice
Bakterijske transpozaze nasuprot retrovirusnim integrazama |
|
| Bakterijska transpozaza je enzim vezan za kraj transpozona, a olakšava katalizu kretanja transpozona u drugi dio genoma kroz različite mehanizme. | Retrovirusne integraze smatraju se retrovirusnim enzimima koji pomažu u integraciji genetskog materijala retrovirusa kao što je HIV u genetski materijal (DNA) stanice koja je zaražena. |
| Obvezujuće regije | |
| Za bakterijske transposaze potrebna su visoko specifična vezna područja. | Za vezivanje je potrebno manje ili nimalo nukleotidne sekvence. |
Sažetak - Bakterijske transposaze nasuprot retrovirusnim integrazama
Bakterijske transpozaze smatraju se retrovirusnim enzimom koji pomaže u integraciji genetskog materijala retrovirusa, poput HIV-a, u genetski materijal (DNA) zaražene stanice. Transponibilni genetski elementi koristili su dvije važne strategije za pomicanje između genoma ili s jednog mjesta na drugo. Trenutno se klasificira pet obitelji transpozaza, ali broj obitelji tek će se povećati s novim znakovima transposaze. Retrovirusna integraza, smatra se retrovirusnim enzimom koji pomaže u integraciji genetskog materijala retrovirusa kao što je HIV u genetski materijal (DNA) stanice koja je zaražena. Proteini retrovirusne integraze obično se sastoje od tri (03) kanonske domene. Glavna funkcija retrovirusne integraze je umetanje svog genetskog materijala u DNK domaćina. Ovaj korak je najvažniji korak u virusnoj replikaciji virusa HIV-a. Stoga, jednom integrirana stanica nema povratka. To je razlika između bakterijskih transpozaza i retrovirusne integraze.
Preuzmite PDF bakterijskih transposaza vs retrovirusnih integraza
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti je u izvanmrežne svrhe prema napomeni. Preuzmite PDF verziju ovdje: Razlika između bakterijskih transpozaza i retrovirusnih integraza
