Ključna razlika između auksina i citokinina je u tome što auksin potiče grananje korijena, dok citokinin inhibira grananje korijena i bočno stvaranje korijena. Da se tome još doda, auxin je uglavnom odgovoran za produljenje stanica na vrhovima stabljike i korijena, dok su citokinini uglavnom odgovorni za diobu stanica, pa ih stoga nalazimo u uzgajalištima.
Fitohormoni poznati i kao biljni hormoni važne su kemijske tvari za rast i razvoj biljaka. Oni su organske molekule i djeluju kao signalne molekule koje reguliraju razvoj biljaka. Postoji pet glavnih vrsta biljnih hormona: auksin, giberelin, citokinin, etilen i apscizinska kiselina. Dakle, oni obavljaju različite funkcije sami i zajedno utječu na rast biljaka.