Ključna razlika između troponina I i troponina T je u tome što se troponin I veže s aktinom, dok se troponin T veže s tropomiozinom tijekom mišićnih kontrakcija.
Troponini su važne molekule proteina koji sudjeluju u kontrakciji mišića. Studije o troponinu uvelike se povećavaju zbog njegove glavne važnosti kao srčanog biljega kod ishemijskih bolesti srca. U ljudskoj fiziologiji postoje tri vrste troponina. Tri odvojena gena kodiraju ove tri vrste troponina; Troponin C, Troponin T i Troponin I. Troponin I i Troponin T koriste se kao kardijalni biljezi u prognozi. Stoga se Troponin I veže na aktinske niti tijekom kontrakcija mišića kako bi zadržao aktin-tropomiozinski kompleks na mjestu. S druge strane, Troponin T se veže za tropomiozin tijekom kontrakcija mišića. Troponin T pomaže tropomiozinu da se odmori na aktinu. Stoga je ključna razlika između Troponina I i Troponina T supstrat na koji se vežu tijekom kontrakcija mišića.