Ključna razlika između bioreaktora i fermentora je vrsta biokemijske reakcije koja se odvija unutar zatvorenih posuda. Bioreaktor olakšava sve vrste biokemijskih reakcija, ali fermentor olakšava samo fermentaciju.
Primjena biotehnologije u industriji zanimljivo je područje znanosti. Te se primjene razlikuju od mikrobnih do aplikacija na životinjama. Nadalje, industrijska primjena biotehnologije razlikuje se u glavnim područjima kao što su poljoprivreda, medicina i razne industrije. Bioreaktori su zatvorene posude u kojima se stvaraju potrebni uvjeti za olakšavanje različitih vrsta biokemijskih reakcija. Fermentori spadaju u skupinu bioreaktora, ali posebno je to potrebno samo za fermentaciju.
