Ključna razlika - YAC vs M13 Phage Vector
Kloniranje DNA važan je postupak koji omogućuje širenje važnih fragmenata DNA organizama. Potrebno je spajanje specifične DNA s vektorskom DNA kako bi se stvorila rekombinantna DNA koja se pretvara u organizam domaćina. Vektor je molekula DNA koja se ponaša kao sredstvo za prijenos stranog genetskog materijala u drugu stanicu ili organizam. Trebao bi se moći replicirati unutar organizma domaćina i proizvesti višestruke kopije rekombinantne DNA. Postoje različite vrste vektora koji se koriste u kloniranju DNA. Umjetni kromosom kvasca (YAC) i vektor faga M13 dvije su vrste među njima. Ključna razlika između vektora YAC i M13 je da je YAC umjetni kromosom koji se replicira u stanicama kvasca, dok je vektor M13 faga jednolančana kružna DNA bakteriofaga M13 koji se replicira u stanicama E Coli.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je YAC
3. Što je M13 fažni vektor
4. Usporedna usporedba - YAC vs M13 fage vektor
5. Sažetak
Što je YAC vektor?
YAC je umjetno izgrađeni kromosom koji ima sposobnost nositi velik segment strane DNA i replicirati se unutar stanica kvasca. Ima centromere, telomere i autonomno replicirajuće sekvence neophodne za replikaciju i stabilnost. YAC bi također trebao nositi selektivni marker ili markere i restrikcijska mjesta kako bi postao učinkovit vektor kloniranja. Velike sekvence u rasponu od 1000 kb do 2000 kb mogu se umetnuti u YAC i prenijeti u kvasac.
Slika 01: YAC vektor
Što je M13 Phage Vector?
Bakteriofag M13 je virus koji inficira i razmnožava se u E Coli. Genom bakterije M13 bakterije je male veličine, oko 6,7 kb. To je jednolančana, kružna i pozitivno osjetljiva DNA. Ovaj virus posebno inficira bakterije E Coli putem F pilusa. Jednom kada uđe u ssDNA u bakteriju, ona sintetizira njezin komplementarni lanac i postaje dsDNA ili replikativni oblik (RF) M13. RF se može ponašati poput plazmida u organizmu domaćina. DsDNA se replicira unutar E Coli i stvara ssDNA koja nosi nove fage. Ti se novi fagi kontinuirano oslobađaju iz E Coli bez ubijanja stanice domaćina. Međutim, infekcija usporava rast E Coli. dsDNA se može ekstrahirati iz bakterijskih stanica i koristiti kao vektori u kloniranju DNA. Poznati su kao M13 fagi vektori. Njima se lako može manipulirati i koristiti slično plazmidnim vektorima.
Inherentna sposobnost infekcije ovih M13 faga služi kao dobra kvalifikacija koja se koristi kao vektor u kloniranju gena. Kada se M13 pretvara u vektor, nekoliko elemenata treba ugraditi u njegov genom. Oni su, gen za protein lac represora (lac I), operativno-proksimalno područje lac Z gena, lac promotor i višestruko mjesto kloniranja (polilinker). Kada se dsDNA M13 koristi kao vektori, može se tretirati kao plazmidni vektor. Međutim, upotreba ssDNA M13 ima prednosti u sekvenciranju DNA i mutagenezi usmjerenoj na mjesto.
Budući da vektor M13 faga nosi višestruko mjesto kloniranja u lacZ regiji, rekombinirani vektori mogu se lako prepoznati skriningom plavo-bijele kolonije na pločama s agarima koji sadrže IPTG i X-Gal. Plave pločice proizvedene na pločama ne sadrže rekombinirane fage. Stoga se u svrhu kloniranja mogu odabrati fagi s umetcima.
Slika 02: Bakteriofag M13
Koja je razlika između YAC i M13 Phage Vector?
Diff Article Sredina prije tablice
YAC vs M13 Phage Vector |
|
YAC je genetski modificirani kromosom koji ima sposobnost nositi velik segment strane DNA i replicirati se unutar stanica kvasca. | M13 fagi vektor je virusni vektor koji je razvio bakteriofag M13 koji se koristi za umetanje strane DNA u E Coli. |
Svrha | |
YAC-ovi su dizajnirani za kloniranje velikih fragmenata genomske DNA u kvasac. | Vektori faga M13 koriste se za umetanje strane DNA u E Coli. |
Duljina umetanja | |
YAC-ovi mogu sadržavati genomske umetke veličine megabaze (1000 kb - 2000 kb). | Veličina umetaka je oko 1500 bps. |
Izgradnja | |
YAC DNK je teško pročistiti netaknutim i zahtijeva visoku koncentraciju za stvaranje YAC vektorskog sustava. | Javlja se putem cikličkog fotosintetskog elektronskog lanca. |
Stabilnost | |
YAC je nestabilan. | M13 fagi se lako mogu izvući. |
Veličina | |
Enzimi su veće molekule. | M13 fagi su stabilni od YAC. |
Sažetak - YAC vs M13 Phage Vector
YAC je umjetno izgrađeni vektorski sustav koji koristi određeno područje kromosoma kvasca za umetanje velikih segmenata genetskog materijala u stanice kvasca. M13 fagi vektor je vektorski sustav izveden iz bakteriofaga M 13 koji koristi E coli kao organizam domaćina. To je glavna razlika između YAC i M13 Phage Vector. Obje su jednako korisne u tehnologiji rekombinantne DNA i kloniranju gena.