Ključna razlika između prokariontskih i eukariotskih ribosoma je ta što su prokariontski ribosomi 70S čestice sastavljene od 50S velike podjedinice i 30S male podjedinice, dok su eukariotski ribosomi 80S čestice sastavljene od 60S velike podjedinice i 40S male podjedinice.
Prokarioti i eukarioti su dvije glavne skupine živih organizama koje se razlikuju od stanične organizacije. Prokarioti ne posjeduju jezgru i membranski vezane stanične organele. S druge strane, eukarioti posjeduju jezgrene i membranski vezane stanične organele. Postoje neke organele zajedničke za oba organizma. Ribozom je jedan od važnih i vitalnih organela prisutan i u prokariotskim i u eukariotskim stanicama. Prisutni su u citoplazmi svake stanice. Strukturno, protein i ribosomska RNA (rRNA) zajedno čine ribosome. Sastoje se od dvije podjedinice, naime veće podjedinice i male podjedinice. Također, oni obavljaju istu funkciju koja je prevođenje molekula mRNA u proteine. Budući da je prevođenje vitalni proces za sve žive organizme i događa se u ribosomima,ribosomi su vrlo važni i za prokariote i za eukariote. Iako imaju mnogo sličnosti, postoje neke razlike između prokariontskih i eukariotskih ribosoma.
