Ključna razlika između fukoidana i fukoksantina je u tome što je fukoidan sulfatirani polisaharid koji sadrži fukozu prisutan u različitim vrstama smeđih algi i smeđim morskim algama dok je fukoksantin ksantofil prisutan kao pomoćni pigment u kloroplastima smeđih algi i drugim heterokontima.
Morski ekosustavi čine i floru i faunu. Imaju veliku raznolikost vrsta. Štoviše, ove vrste sadrže različite spojeve koji su korisni za ljude. Biomolekule ekstrahirane iz ovih vrsta u morskim ekosustavima sadrže različite terapijske potencijale. Fukoidan i fukoksantin dva su takva spoja prisutna u morskim ekosustavima, uglavnom u smeđim algama. Iako se kemijski razlikuju, oba se spoja trenutno koriste u različite istraživačke svrhe kako bi se identificirao njihov potencijal kao terapeutika.