Ključna razlika između krvno-moždane barijere i krvno-cerebrospinalne barijere je ta što je krvno-moždana barijera barijera koja razdvaja krvno tkivo i moždano tkivo, dok je krvna moždanska barijera funkcionalna barijera koja razdvaja krvno tkivo i cerebrospinalnu tekućinu.
Krvno-moždana barijera i krvna likvor su dvije zaštitne barijere u mozgu. Također su važni u transportu molekula kroz mozak i tkiva periferne krvi. Osim toga, obje barijere imaju uske spojeve koji olakšavaju prijenos netoksičnih spojeva u mozak.