Ključna razlika između geitonogamije i ksenogamije je ta što je geitonogamija prijenos peludi na stigmu drugog cvijeta iste biljke, dok je ksenogamija prijenos peludi na stigmu drugog cvijeta koji pripada genetski različitoj biljci. Geitonogamija je vrsta samooprašivanja, dok je ksenogamija vrsta unakrsnog oprašivanja.
Golosjemenjače se za oplodnju i proizvodnju sjemena oslanjaju na oprašivanje. Peludi antera prelaze u stigmu tučaka tijekom oprašivanja. Oprašivanje se može dogoditi između muško-ženskih dijelova istog cvijeta ili između dva cvijeta iste biljke ili između dva cvijeta različitih biljaka. Ako se oprašivanje dogodi između dva cvijeta iste biljke, poznato je kao geitonogamija, dok ako se dogodi između dva cvijeta različitih biljaka, poznato je kao ksenogamija.