Ključna razlika između egzoskeleta i endoskeleta je u tome što je egzoskelet vanjski kostur prisutan izvan tijela životinje, dok je endoskelet unutarnji kostur prisutan unutar tijela životinje.
Tijelo živog organizma, bilo da je to medonosna pčela ili čovjek, složena je mreža različitih organa. Ti organi izvršavaju nekoliko vlastitih funkcija, osim što su međusobno povezani za skladno, uravnoteženo i funkcionalno tijelo. Sve su složena čuda prirode jer svaka vrsta ima svoju posebnost. Neki imaju samo endoskelet, dok neki imaju samo egzoskelet, dok neki imaju oba za podršku. Kao što i samo ime govori, egzoskelet locira izvan tijela, dok endoskelet locira unutar tijela. Vanjski kostur štiti i također podupire tijelo životinje. S druge strane, endoskelet pruža potporu i zaštitu i unutarnjim mekšim i krhkim organima poput srca, pluća i bubrega itd.