Ključna razlika između protein kinaze A i protein kinaze C je u tome što je protein kinaza A vrsta protein kinaze koja ovisi o cikličnom AMP, dok je protein kinaza C podporodica protein kinaza koja reagira na lipidnu signalizaciju.
Kinaza je enzim koji katalizira prijenos fosfatne skupine s visokoenergetskih molekula koje doniraju fosfate na određene supstrate. Taj proces nazivamo fosforilacijom. Kinaze reguliraju većinu staničnih putova, uključujući prijenos signala. Proteinske kinaze su posebna vrsta kinaza koje kataliziraju fosforilaciju proteina ili prenose fosfat u precizne supstratne proteine. Ti enzimi reguliraju biološku aktivnost proteina fosforilacijom specifičnih aminokiselina s fosfatnim skupinama iz ATP-a. Jednom kada se dogodi fosforilacija, neaktivni se proteini transformiraju u aktivne proteine zbog konformacijske promjene. Protein kinaza C i protein kinaza A dvije su vrste proteinskih kinaza koje pripadaju podporodici: AGC kinaza proteinskih kinaza.