Ključna razlika između Apicomplexia i Ciliophora je u tome što je Apicomplexia podfil praživotinja i uključuje organizme s apikalnim kompleksom, dok je Ciliophora još jedan podphill protozoa koji uključuje organizme s cilijama.
Praživotinje su jedna od dvije glavne skupine koje pripadaju Kraljevstvu Protista. Druga skupina su alge. Praživotinje su jednoćelijske životinje poput eukariotskih organizama. Pripadaju četiri klase: Sarcodina (amebe), Ciliophora (cilijati), Zoomastigophora (bičevi) i Apicomplexa. Apicomplexia imaju strukturu poznatu kao apikalni kompleks, dok članovi Ciliophora imaju tisuće trepavica na površini organizma.
