Ključna razlika između tihe i neutralne mutacije je u tome što je tiha mutacija specifična vrsta neutralne mutacije koja nema vidljiv učinak na fenotip organizma, dok je neutralna mutacija promjena u sekvenci DNA koja nije ni korisna ni štetna za sposobnost organizam da preživi i razmnoži se.
Mutacija je promjena koja se događa u nukleotidnom slijedu DNA. Mutacija se može dogoditi zbog okolišnih čimbenika poput cigaretnog dima i UV svjetla ili zbog virusnih napada, jakih kemikalija itd. Mutacije u stanicama zametne linije prelaze u sljedeće generacije, dok mutacije u ne-zametnim stanicama (somatske mutacije) ne prolaze u sljedeće generacije, a oni će utjecati na opstanak jednog organizma. Tihe mutacije ne rezultiraju promjenama u aminokiselinskom slijedu kodiranog proteina. Neutralne mutacije ne uzrokuju uočljiv učinak na fenotip organizma.
