Ključna razlika - Endonukleaza i Eksonukleaza
Prije nego što pogledamo razliku između endonukleaze i eksonukleaze, važno je znati što je točno nukleaza. Nukleaza je enzim sposoban cijepati fosfodiesterske veze između nukleotida u nukleinskim kiselinama. Endonukleaza i eksonukleaza dvije su klasifikacije nukleaza. Ključna razlika između endonukleaze i eksonukleaze je u tome što endonukleaze cijepaju veze između nukleotida unutar molekule nukleinske kiseline, dok eksonukleaze cijepaju vezu između nukleotida na 3 'ili 5' krajeva molekule nukleinske kiseline.
SADRŽAJ
1. Pregled i ključna razlika
2. Što je nukleaza
3. Što je endonukleaza
4. Što je eksonukleaza
5. Usporedna usporedba - Endonukleaza i eksonukleaza
6. Sažetak
Što je nukleaza?
Nukleaza je enzim koji ima sposobnost cijepanja fosfodiesterskih veza između nukleotida u nukleinskim kiselinama. Pripada skupini enzima hidrolaze, jer hidrolizira kemijske veze između nukleotida. Ovaj enzim je neophodan za prirodne mehanizme popravljanja DNA koji se javljaju u stanicama i u biotehnološkim procesima kao što su kloniranje gena, tehnologija rekombinantne DNA, RFLP, AFLP, sekvenciranje gena, genska terapija, mapiranje genoma itd.
Dvije su glavne vrste nukleaza: ribonukleaza i deoksiribonukleaza, koje djeluju i razbijaju kemijske veze između monomera RNA i DNA. Prema mjestu djelovanja nukleaza, oni se dalje svrstavaju u dvije skupine i to endonukleazu i eksonukleazu. Endonukleaze prepoznaju specifična područja sekvence nukleinskih kiselina i cijepaju fosfodiesterske veze između nukleotida koji se nalaze u sredini nukleinskih kiselina. Eksonukleaze cijepaju fosfodiesterske veze između nukleotida koji se nalaze na krajevima nukleinskih kiselina.
Slika 1: Nukleazna aktivnost
Što je endonukleaza?
Endonukleaza je vrsta nukleaza koja cijepa nukleinske kiseline iz sredine. Prepoznaje specifične nukleotidne sekvence nukleinske kiseline i prekida kemijske veze između nukleotida. Poznati su i kao restrikcijski endonukleazi jer pretražuju određena restrikcijska mjesta i cijepaju vezu i proizvode restrikcijske fragmente. Više od 100 restrikcijskih endonukleaza identificirano je u bakterijama i arhejama i dobiva se u komercijalne svrhe.
Restrikcijske endonukleaze intenzivno se koriste u biotehnologiji. Oni igraju vitalnu ulogu u molekularnom kloniranju. Većina su dimerni enzimi sastavljeni od dvije proteinske podjedinice. Dvije proteinske podjedinice obavijaju dvolančanu DNA i odvojeno cijepaju obje niti s obje strane. Postoje stotine vrsta restrikcijskih endonukleaza s jedinstvenim mjestima prepoznavanja u bakterijama. Zbog svoje visoke specifičnosti u ograničenju, cijepaju se samo u određenim sekvencama. Stoga se smatraju vrlo korisnim molekularnim alatima u tehnologiji rekombinantne DNA. Bez restrikcijskih endonukleaza, proizvodnja rekombinantne molekule DNA nije moguća. Stvaranje rekombinantne molekule DNA osnovni je korak većine molekularno-bioloških tehnologija.
Da bi razumjeli jedinstveno prepoznavanje sekvenci restrikcijskim endonukleazama, sljedeći će primjer pomoći čitateljima.
Bam HI je restrikcijska endonukleaza koja pretražuje sljedeće restrikcijsko mjesto u molekuli DNA (mjesto je prikazano crvenim slovima).
Jednom kada Bam HI odcijepi nukleinsku kiselinu s restrikcijskog mjesta, ona stvara sljedeća dva fragmenta.
EcoRI je još jedna restrikcijska endonukleaza vrlo korisna u tehnologiji rekombinantne DNA koja djeluje na njezinu specifičnom mjestu prepoznavanja restrikcija i cijepa DNA kao što je prikazano na slici 2.
Slika 2: EcoRI
Što je Exonuclease?
Eksonukleaza je nukleazni enzim koji cijepa kemijske veze između nukleotida na 3 'ili 5' krajevima lanaca nukleinske kiseline. Razbija pojedinačne nukleotide na kraju lanca i stvara nukleozide prenoseći fosfatne skupine u vodu. Eksonukleaze se nalaze u arhejama, bakterijama i eukariotima. U E coli prisutno je 17 različitih egzonukleaza, uključujući DNA polimere 1, 2 i 3. Nekoliko DNA polimeraza pokazuje aktivnost korekcije eksonukleaze od 3 'do 5'.
Eksonukleaze su važne u popravljanju DNK, genetskoj rekombinaciji, prevenciji pojave mutacija, stabilizaciji genoma itd.
Slika 3: Egzonukleazno djelovanje RecBCD E Coli
Koja je razlika između Endonuclease i Exonuclease?
Diff Article Sredina prije tablice
Endonukleaza vs Eksonukleaza |
|
| Endonukleaza je vrsta enzima nukleaze koji cijepa veze između nukleotida unutar molekule nukleinske kiseline. | Eksonukleaza je vrsta enzima nukleaze koji cijepa vezu između nukleotida na 3 'ili 5' krajevima molekule nukleinske kiseline. |
| Krajnji proizvodi | |
| Endonukleaze proizvode oligonukleotidne restrikcijske fragmente | Eksonukleotidi proizvode nukleozide |
| Funkcija | |
| Oni prekidaju fosfodiesterske veze i proizvode restrikcijske fragmente. Ali oni jedno po jedno uklanjaju nukleotide. | Uklanjaju nukleotide jedan po jedan s krajeva nukleinskih kiselina. |
| Primjeri | |
| Primjeri uključuju Bam HI, EcoRI, Hind III, Hpa I, Sma I, | Primjeri uključuju Exonuclease I, Exonuclease III, RecBCD (Exonuclease V), RecJ exonuclease, Exonuclease VIII / RecE, Exonuclease IX, Exonuclease T, Exonuclease X itd. |
Sažetak - Endonukleaza vs Eksonukleaza
Nukleaze su odgovorne za razbijanje fosfodiesterskih kemijskih veza između nukleotida nukleinskih kiselina. Nukleaze mogu djelovati na unutar ili na krajevima lanca nukleinske kiseline. Prema mjestu djelovanja, u organizmima se nalaze dvije glavne vrste nukleaza. Oni su endonukleaza i eksonukleaza. Endonukleaze cijepaju nukleotide iz sredine lanca, dok eksonukleaze cijepaju nukleotide s krajeva lanca nukleinske kiseline. Endonukleaze su vrlo važne u tehnologiji rekombinantne DNA jer prepoznaju specifične sekvence baza unutar lanca nukleinske kiseline i prekidaju veze između nukleotida.
