Ključna razlika između mezoderma i mezenhima je u tome što je mezoderm jedan od tri klica slojeva obostrano simetričnih životinja, dok je mezenhim nediferencirano tkivo koje se nalazi u embrionalnoj pravoj mezodermi.
U diploblastičnih životinja plan tijela relativno je jednostavan s dva sloja stanica. Dva su sloja vanjski ektoderm i unutarnji endoderm. Stanice ektoderma okrenute su prema okolišu, a stanice endoderma okrenute su prema enteronu, koji je šupljina s jednim otvorom prema van. Otvor su usta. Štoviše, triploblastično stanje je stanje u kojem se u embriju razvija treći sloj poznat kao mezoderm. Mesoderm leži između ektoderma i endoderma, razdvajajući dva sloja stanica. Treći sloj važan je za tijelo. U određenih životinja velik dio mezoderme ostaje nediferenciran i tvori ambalažno tkivo poznato kao mezenhim, koje podupire i štiti tjelesne organe.