Ključna razlika između himere i mozaika je broj zigota koje sudjeluju u stvaranju svakog organizma. Različite stanične populacije potječu iz dviju zigota u himeri, dok različite stanične populacije potječu iz jedne zigote u mozaiku.
Himera i mozaik u početku su bili mitski koncepti genetske kombinacije. Međutim, s napretkom genetike i molekularne biologije, sada je moguće znanstveno objasniti pojave kimerizma i mozaicizma. I u himerizmu i u mozaicizmu, neke tjelesne stanice nose drugačiji genom. Dakle, isto tkivo može sadržavati dvije ili više različitih staničnih populacija. Dalje, dvije zigote sudjeluju u stvaranju embrija koji se razvija u himeru, dok pojedinačna zigota sudjeluje u stvaranju embrija koji se razvija u mozaik. Mutacija u ranom razvoju razlog je mozaicizma, dok je zahvaćenost dviju različitih zigota razlog kimerizma.
